Святой Иоанн Пустынник происходил из могущественного племени полабских славян, именуемых иначе ободритами. Его отец Гостомысл был князем у ободритов. В 844 году во время сражения с войсками императора Людовика Немецкого Гостомысл погиб. После того как собратья святого Иоанна были истреблены чужеземцами, он ушел в уединение в чешские леса для духовного совершенствования. Там в течении 42 лет Иоанн подвизался в полном одиночестве. На склоне жизни его обнаружил во время охоты чешский князь Боривоем. Житие святого так повествует об этом:

Однажды Боривой со своими людьми вышел на охоту. Когда он заехал далеко в лес, то встретил лань и выстрелил в нее из лука. Лань стала убегать. Она привела погнавшегся за ней Боривоя к высокой скале, из которой бил источник воды. Лань стала пить воду. Князь слез с коня и убил ее копьем. Но вместо крови из раны потекло молоко, чему все сильно удивились. Через минуту из чащи вышел некий муж, весьма страшный. Все тело его было покрыто волосами. Он сказал: "Зачем ты убил мою лань?" Боривой испугался, увидев его, и спросил: "Почему же она была твоей?" Тот ответил: "Она питала меня на этом месте сорок два года". Боривой спросил: "Кто ты и что здесь делаешь?" Незнакомец ответил: "Я Иоанн из земли Хорватской. Живу здесь сорок два года. И ни один человек меня здесь до сих пор не видел". Боривой пригласил его в свой дом. Иоанн сказал ему: "Я не езжу на коне, пошли ко мне священника, с ним я пойду, куда скажешь".

Боривой отправил к нему священника Павла. Сам же вышел встречать пустынника вместе с женой - святой Людмилой. Иоанн выслушал божественную службу, причастился Святых Христовых Таин и не хотел ничего пить или есть. Он просил, чтобы его отвели назад в уединение. Вернувшись в пустыню, святой вскоре скончался. После смерти у Ианна была найдена грамота, свидетельствовавшая о том, что он сын короля Гостомысла.