Проблема реставрационно-консервационных мероприятий и реконструкции в Херсонесе Таврическом сегодня одна из наиболее актуальных, поскольку городище разрушается. Отсутствие финансов и квалифицированных реставраторов вынуждает руководство экспедиции действовать на свой страх и риск.

Нельзя умолчать о ситуации с консервацией пятиапсидного храма в южной части городища, датируемого XI—XIII вв. Особенно трагична судьба купели баптистерия, являющейся одной из самых поздних средневековых стационарных крещален, уникальной тем, что для обряда крещения тогда уже использовались переносные купели, стоявшие в нартексе или в западной части боковых нефов церквей.

В 2003 г. купель находилась в первозданном виде, а в 2004-м был значительно изменен ее внешний вид. Блок с водоемом подвергся своеобразной реконструкции: разрушены сохранившиеся оригинальные стенки купели, а взамен с помощью опалубной доливки были возведены новые стенки из белого бетона. Попутно специалисты «ликвидировали» осколки оригинального камня и на других ее стенках.

Экспедиция Харьковского национального университета с 1998 г. занимается плановыми консервационно-реставрационными мероприятиями на территории херсонесской «цитадели» и следит за методиками, применяемыми в Херсонесе. Не обнаружив копии отчета о работах на территории пятиапсидного храма в 2003г. в научном архиве Национального заповедника «Херсонес Таврический», мы обратились за консультацией к ученому секретарю заповедника Е.Клениной. Украинско-польский отряд под руководством Е.Клениной и профессора Познанского университета А.Бернадски ведет исследования этого храма. Из предоставленного отчета, касающегося проведенных работ, выяснилось, что он очень мал и не в полной мере отражает проведенные работы. Прокомментировать случившееся нам отказались, мотивируя тем, что исследователь имеет право в течение пяти лет работать с вновь открытым материалом.

Проведенные работы в Херсонесе не подпадают под категорию консервационных, поскольку примененная методика необратима и уничтожила уникальный объект. Это и не реконструкция, так как максимально не учтено визуальное восприятие памятника. К тому же купель была раскопана не в 2001—2003 гг., а значительно раньше и не авторами ее «реставрации». Поэтому заявление о 5-летнем сроке не может служить оправданием случившемуся.

Доктор исторических наук, начальник экспедиции «Цитадель» ХНУ им. В. Н. Каразина С. Сорочан отмечает: «Наша экспедиция разработала собственную структуру такого раздела отчета и применяет ее с 1998 г. Разумеется, мы далеки от того, чтобы выставлять предложенное в качестве идеального образца, достойного слепого подражания. Консервация следов прошлого — дело чрезвычайно деликатное, и едва ли для него можно подобрать универсальный рецепт. К сожалению, археологи, исходя из самых лучших побуждений, зачастую безвозвратно губят памятник. Именно это и произошло с купелью пятиапсидного храма Херсонеса Таврического».